都察院，主掌监察、弹劾及建议，负责纠察、弹劾官员、肃正纲纪。

【左都察院】监察百官，廉政反腐。

【右都察院】信访采风，百姓投诉。

【监察司】地方监察御史使司。

【纪委司】纪律检查委任使司。

【暗行司】暗行御史使司。

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格物院，中华联邦中央科学院，负责科学技术研究，经李丞相改制后分为探天阁和人文苑两部分。

探天阁——

【算学部】研究数学、算法和逻辑学。

【物理学部】研究物理学。

【化学部】研究化学和材料学。

【生物医学部】研究生物学、医学。（大多兼任太医院之职）

【地学部】研究地理学、地质学、地球环境学等。

【信息学部】研究电子信息学。

【机关学部】研究机械机器学。

【工程技术学部】研究工程学。

人文苑——

【语言学部】研究各类语言、文字、音律、符号、密码。

【社会学部】研究人类社会活动。

【心理学部】研究心理学。

【政治学部】研究政治学。

【经济学部】研究经济学。

【律法学部】研究律法学。